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大肠杆菌高细胞密度发酵裂解液澄清工艺优化

在生物制药过程中,大肠杆菌可溶性重组蛋白表达的方法通常用于表达有价值的重组蛋白,酶,质粒和治疗产品,但是随着目标蛋白从大肠杆菌裂解物中的释放,产生大量的细胞碎片,核酸和其他杂蛋白将下游纯化和分离过程从实验室转化为工业的技术难题之一


摘要

   在生物制药过程中,大肠杆菌可溶性重组蛋白表达的方法通常用于表达有价值的重组蛋白,酶,质粒和治疗产品,但是随着目标蛋白从大肠杆菌裂解物中的释放,产生大量的细胞碎片,核酸和其他杂蛋白将下游纯化和分离过程从实验室转化为工业的技术难题之一;本文选择了在大肠杆菌中具有较强可溶性表达稳定性的重组蛋白,选择了不同的裂解方式料液进行澄清洗滤,较详细研究了切向流过滤技术中影响大肠杆菌裂解液澄清的工艺参数,最后弄清了各操作参数对澄清效果和最佳操作间隔的影响,从而获得了适用于工业的澄清过滤的优化方法扩增方法

引言

 裂解大肠杆菌后,裂解液的切向流澄清和过滤具有易于线性扩增和易于自动化的优点。它是当前生物医学工业化过程中的主要分离方法之一。切向流的澄清和裂解物的过滤可以自由地在上游进行。细菌被分解并迅速转移到下游色谱过程中,而无需花费更多时间等待样品实现良好的连续过程。特别是对于相对不稳定和敏感的蛋白质,采用切向流微滤澄清方法是温和分离蛋白质以保持蛋白质活性,功能和稳定溶液环境的首选。实验方案是离心培养的大肠杆菌以收集细菌,并使用粗离心除去较大的细胞碎片,然后通过切向流微滤膜包装除去离心无法除去的碎片和大分子杂质,从而富集蛋白质到达渗透端,降低溶液的生物负荷,降低后续过滤步骤的压力,并保护后续工艺色谱。同时,填料有望获得低浊度,高收率的澄清工艺,通量高,寿命长;

在操作方面,有必要考虑过滤方法的选择。切向流超滤仅需控制几个主要工艺参数,例如流速和TMP。通常用于成分基本可溶,没有明显沉淀的原料,即不会在膜上形成明显的覆盖层,在微滤过程中,经常会发生极化极化现象。通过控制渗透端的压力,可以有效地减少浓差极化的形成。

根据澄清过程的组成,策略优化模块分为操作膜模块(膜包装/中空纤维),膜孔径,膜材料,进料液特性(破碎时间,裂解液盐浓度,裂解液pH和发酵) ,运行参数(进料速度,TMP,膜负载,浓缩倍数,过滤次数和过滤方法),优化过程中,澄清后的浊度,澄清产率,为了弄清回收率以确定优化结果,这些模块中涉及的参数相互影响和制约,从而达到提高生产效率,节约成本的目的。

实验方法

1.分解和收集细菌

从冰箱中取出细胞,根据细胞与缓冲液的一定比例(1:10)(gml)加入4-10℃的预冷细胞以裂解缓冲液,然后将其均匀搅拌,使用高压均质机破碎大肠杆菌溶液和化学裂解两种方法获取细菌裂解液。根据不同的裂解工艺,选择合适的膜孔径、筛网和膜面积对其进行澄清过滤

2.切向流澄清和过滤以收集目标产物

切向流过滤操作

膜组件的选择:根据切向流澄清和过滤的要求,选择离心/未离心的细菌裂解液样品,选择切向流方式进行澄清过滤,膜组件:微滤膜包(杭州九龄,G01100022MG01100045MG01100065M),并按照说明进行连接膜组件,并设置膜进口流速,膜组件的进口和回流口压力,控制进料流速和渗透流速以避免膜表面形成浓差极化,减少膜孔阻塞。

膜清洗:在使用膜组件之前,先排干储存液,首先冲洗回流端,将软管置于渗透端和回流端处于排水状态,用纯净水冲洗10-20L / m2.min,回流阀完全打开,然后冲洗端,将软管的返回端放到入口端,排放端处于排放状态,用纯净水冲洗20-30 L / m2,然后用细菌裂解缓冲液冲洗直至平衡后排空。

澄清裂解液,将短入口的软管插入并返回样品中,将软管的一端插入干净的容器中收集膜下的液体,缓慢启动系统,并调节渗透端的压力和流速,直到稳定为止。

裂解液洗涤和过滤:洗涤过程是恒定量的间歇性洗涤和过滤,根据浓缩膜的上样量,测量相同体积的细菌裂解缓冲液以稀释浓缩膜,然后上样并均匀悬浮。收集先前浓缩膜的样品体积,并分别收集该渗透样品。

膜清洗:首先冲洗回流端,将软管置于渗透端和回流端处于排放状态,冲洗2-3L / min的纯净水,然后回流阀完全打开。

样品处理后,将5×浓缩膜样品量和3×洗涤膜样品量之和作为整个切向流过滤的目标,色谱法处理了三个样品

不同的膜组件:试验采用了不同膜孔径,主要考察其流速、样品回收率等。考虑到膜组件的类型和用途,对膜包装的评估分为离心和非离心裂解液,裂解物样品的具体含量包括:均质机破碎和化学裂解;取一小部分样品,用于后续色谱分析和比较

浊度检测:取10ml待测样品(破碎细胞澄清的裂解物的靶标),不要稀释,直接用浊度计检测,并按照浊度计的说明直接读取

样品回收率计算

澄清收率:以未澄清处理的菌体裂解液离心上清液经过层析后蛋白产率作为对照,计算澄清处理获得的膜下液(目标产物)经过层析后的蛋白产率占对照蛋白产率的百分比

总回收率:以未澄清处理的菌体裂解液离心上清液经过层析后的蛋白产率为对照,计算澄清处理获得的膜下液(目标物)经过层析后的蛋白产率加上膜上液(废弃物)经过层析后的蛋白产率之和占对照蛋白产率的百分比

实验结果与讨论

1.膜组件对澄清和过滤的影响

膜组件的结构影响传质,清洁,维护和操作的难度,甚至在一定程度上影响蛋白质的稳定性,微滤澄清过程中使用的膜组件主要是:由不同孔径的平板膜组成的膜组件,以满足从低浓度到高浓度进料液的需求。在一定程度上可以促进混合和物料转移,同时采用适合粗料处理的筛网,可以处理高固体,高粘度液体而不会发生堵塞,具有良好的物理和化学耐性,并且易于清洁,采用微滤膜包进行澄清过滤,其耐压性,稳定性和高浓度均较好,具有线性放大的优势

实验数据如下:

1)膜包装0.22um:离心后的处理液,回收率68%,未离心的处理液收率为73

2)膜包装0.45um:离心后的处理液,回收率69%,未离心的处理液收率为75

3)膜包装0.65um:离心后的处理液,回收率65%,未离心的处理液收率为77

比较具有不同孔径的膜包,产率通常是稳定的,不同的孔径对蛋白质的回收率影响很小,但对处理时间和浊度有较大影响。

细胞裂解物包含两个部分,可溶的和不溶的,不溶部分主要是细胞碎片,高速离心可以去除较大的细胞碎片,减少了膜包的生物负荷;因此,从理论上讲,离心后原料溶液的澄清产率应高于未离心的原料溶液,离心后会造成部分目标蛋白的损失;平板膜包由膜和无纺布复合而成,无纺布具有支撑和膜时,膜层本身很薄,而且传质阻力低,蛋白质吸附低,因此目标产物的回收率高

全面的澄清和过滤效果评估,膜包装非常适合澄清和过滤裂解物,目标产物回收率高,处理速度快,适合离线扩增。

  

                  (均质机破碎裂解液,未经过离心澄清效果图)

 

                    (化学法破碎裂解液,未经过离心澄清效果图)

 

膜截留分子量对澄清过滤的影响

  适当的膜孔径可防止裂解物中的颗粒进入膜孔,从而导致膜孔堵塞和通量降低。较大的膜孔将被细胞碎片或其他颗粒污染物阻塞,较小的膜孔将被胶体物质聚集堵塞。处理的目的是破坏大肠杆菌的裂解物,因此用于实验设计的膜的分子量截止值为0.2um,0.45um,0.65um。表2表明,分别处理了几种不同的孔径后,浊度,澄清产率,总回收率和通量的差异。从理论上讲,几种膜属于同一材料的改性亲水膜,因此裂解物在膜上的吸附,污染和浓度差异非常高。化学层的效果可能没有明显差异,因此测试结果与理论相符。此外,四种不同孔径的膜包装的总回收率之间的值都浮动在10%以内,可以忽略不计。

膜孔径

浊度

澄清收率

总回收率

通量

膜包0.22um

3.96NTU

71.2%

98.3%

10.6L/m2.h

膜包0.45um

5.66NTU

73.5%

95.2%

13.5L/m2.h

膜包0.65um

9.33NTU

72.7%

96.1%

15.9L/m2.h

从破碎细菌的澄清裂解物的浊度观察,随着膜的孔径变大,浊度增加,这表明较大颗粒的杂质已经渗透到膜孔中,这影响了渗透物的浊度,特别是0.45um浊度比较大;另外,从澄清产率来看,随着膜孔径的增加,目标产物的回收率增加,表明膜对蛋白质的排斥率逐渐降低,即更易于渗透膜,穿过膜层的膜,细胞碎片和其他物质的分离效果将引起色谱负担;观察不同膜孔径的数据,膜孔径越小,产率越低,可能是因为孔径很小裂解液中的物质阻塞了孔,导致了浓差极化,因此两者的通量均较低

切向流速度和TMP对澄清过滤的影响

   考虑到一般的膜通量下降主要是由于浓差极化引起的膜污染,适当的切向流速是为了增加膜表面的进料速度,如果流速快,则浓差极化层薄或难以形成,但是流速的增加将增加对蛋白质的剪切力,较慢的流速将减小剪切力,但浓差极化层的厚度会影响膜通量;另外,较高的切向流需要更快的速度泵和更大的直径。毫无疑问,对于工业放大过程,管道将增加设备成本并增加液体的死体积,后者通常会降低产品的产量;跨膜压力是影响膜污染的另一个关键参数。切向流速决定了入口端的压力。通常,微滤澄清将对渗透物端施加一定的压力,以最大程度地减少浓差极化层的形成,但又不会太高而阻碍渗透。因此,跨膜压力的调节是回流侧压力的调节。通过增加返回侧的压力,然后增加跨膜压力,可以压缩浓差偏振层并阻塞膜。由于进料液体的缘故,降低回流侧的压力可能会导致渗透时间增加。直接进入质量方向趋于返回终点,实验设计易于操纵固定的切向速度,跨膜压力的变化,观察两者的澄清作用;

当切向流速设置为较低时,跨膜压力较低时,澄清产率,总回收率和澄清百分比通常较高,这可能是因为切向流速较低且跨膜压力较低,使得浓差极化层形成较薄的厚度并较轻地阻塞膜孔,因此澄清效果更好。随着跨膜压力的增加,澄清效果逐渐降低,但逐渐下降的趋势趋于稳定。跨膜压力的增加使浓度偏振层变厚。当其达到更强的水平时,也就是说,大多数小孔已被堵塞,下降程度趋于稳定;将切向流速设置较高时,实验数据在一定程度上相似。

结果表明,当跨膜压力低时,澄清效果较好;随着跨膜压力的增加,澄清效果逐渐降低,但切向流速超过一定的流速时,其澄清效果随跨膜压力的增加而增加;压力上升和下降时的趋势。可能是在高切向流速的条件下,所形成的浓差极化层很薄。即使增加回流端的压力,浓度浓差极化层也会增强,膜会被堵塞,但被堵塞的程度较轻。随着跨膜压力的增加,浓差极化层的厚度和强度逐渐变化。但是,该程度还不足以形成低切向流,因此澄清了实验现象:该百分比一直在下降,但没有暂时的稳定性

跨膜压力和切向流速对通量的影响,切向流量较低的操作的膜通量低于高流量操作的膜通量,这可能是由于流量低所致,表面的附着较好,容易形成厚的浓差极化层,即使跨膜压力增加,也难以增加透过率,甚至引起部分膜堵塞。切线流速较高的操作对膜表面有很好的效果。浓液的腐蚀作用减少了浓液极化层的形成;综合平衡膜的澄清产率和膜通量,实验表明,对于大肠杆菌破碎的裂解物,高切向流和低跨膜压力的操作易于获得高通量和高产率的澄清效果。

结论

  采用切向流微滤膜包进行过滤,选用了不同的膜孔径,优化设计有的开放式流道,可以对大肠杆菌破碎液直接进行澄清过滤,其回收率高于传统的离心方法,由于膜包的紧凑结构设计,其具有等比放大的优点,在工业生产上是可行和经济的,且处理时间远优于离心处理时间;限于篇幅和能力水平,对于料液粘度较大,固含量较高的不同胞内表达料液,未做进一步研究,同时对抗原性蛋白、凝血因子等会对膜产生特异性吸附的,需要进一步优化工艺;同时,如果在尽可能降低增大原液体积的条件下,尽可能高的提高回收率,也是需要解决的难点之一